MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. RpGvF24 chromosome

Total Repeats: 8269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017057	ATT	2	6	834	839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017057	TATT	2	8	869	876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017057	GTT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017057	ACA	2	6	927	932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017057	ACA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017057	ATTT	2	8	1300	1307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017057	TAG	2	6	5885	5890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017057	ATT	2	6	5896	5901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017057	TCT	2	6	5902	5907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017057	GTT	2	6	5909	5914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017057	TAA	2	6	5927	5932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017057	TA	3	6	5937	5942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017057	T	9	9	5994	6002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017057	CAT	2	6	6023	6028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017057	TAA	2	6	6038	6043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017057	ATA	2	6	6121	6126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017057	GGCT	2	8	6127	6134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017057	TA	4	8	6157	6164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017057	ATT	2	6	6175	6180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017057	TTTA	2	8	6200	6207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017057	TAAA	2	8	6219	6226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017057	TTA	2	6	7504	7509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017057	ATT	2	6	7555	7560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017057	AT	3	6	7581	7586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017057	ACA	2	6	7638	7643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017057	TA	3	6	8734	8739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017057	TAT	2	6	8751	8756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017057	TGACT	2	10	8808	8817	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017057	TTA	2	6	8864	8869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017057	TAA	2	6	8905	8910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017057	ATTT	2	8	8916	8923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017057	TTTA	2	8	8964	8971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017057	GATAC	2	10	8992	9001	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017057	TTA	2	6	9009	9014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017057	A	6	6	9068	9073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017057	ACC	2	6	9082	9087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017057	GTA	2	6	9113	9118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017057	CAT	2	6	9143	9148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017057	ATT	2	6	9156	9161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017057	CAT	2	6	9179	9184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017057	ACA	2	6	9191	9196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017057	TAA	2	6	9200	9205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017057	TATT	2	8	9212	9219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017057	TAAT	2	8	9258	9265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017057	TTA	2	6	9341	9346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017057	ATTTA	2	10	9351	9360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017057	TAT	2	6	9403	9408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017057	AAT	2	6	9453	9458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017057	TAT	2	6	9477	9482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017057	TTTTAT	2	12	10701	10712	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017057	AGA	2	6	11811	11816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017057	ATA	2	6	14368	14373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017057	TTA	2	6	14378	14383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017057	TA	3	6	14390	14395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017057	GTT	2	6	14433	14438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017057	TTA	2	6	14447	14452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017057	GTA	2	6	14464	14469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017057	A	7	7	14469	14475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017057	TTG	2	6	14500	14505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017057	ATT	2	6	14514	14519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017057	T	6	6	14551	14556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017057	AT	3	6	14558	14563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017057	TA	3	6	14586	14591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017057	TAAAC	2	10	14641	14650	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017057	ATT	2	6	14665	14670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017057	ATC	2	6	14705	14710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017057	TAAG	2	8	14761	14768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017057	ATTA	2	8	14782	14789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017057	AAG	2	6	14816	14821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017057	AAAG	2	8	14851	14858	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017057	A	6	6	14899	14904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017057	ATT	2	6	14927	14932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017057	TTG	2	6	14940	14945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017057	ATT	2	6	14986	14991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017057	AT	3	6	15003	15008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017057	TTAT	2	8	15023	15030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017057	A	7	7	15098	15104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017057	AAG	2	6	15196	15201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017057	TAAG	2	8	15217	15224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017057	ACA	2	6	15270	15275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017057	A	7	7	15280	15286	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017057	AGA	2	6	15328	15333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017057	AAT	2	6	15419	15424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017057	ACA	2	6	15470	15475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017057	ATT	2	6	15500	15505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017057	ACT	2	6	15521	15526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017057	TCA	2	6	15569	15574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017057	AATA	2	8	15646	15653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017057	TAG	2	6	15685	15690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017057	AGC	2	6	15693	15698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017057	GTA	2	6	15752	15757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017057	AGT	2	6	15767	15772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017057	GTAA	2	8	15794	15801	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017057	TGA	2	6	15814	15819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017057	ATC	2	6	15835	15840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017057	AG	3	6	15848	15853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017057	A	6	6	15876	15881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017057	TAG	2	6	15885	15890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017057	TCAAT	2	10	15892	15901	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017057	A	6	6	15934	15939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017057	GAA	2	6	16028	16033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017057	AGCA	2	8	16074	16081	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017057	TGA	2	6	16087	16092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017057	AATCA	2	10	16113	16122	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017057	GAA	2	6	16148	16153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017057	A	7	7	16175	16181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017057	TAA	2	6	16186	16191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017057	A	6	6	16195	16200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017057	A	7	7	16222	16228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017057	CTA	2	6	16272	16277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017057	CAA	2	6	16305	16310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017057	GAAGAT	2	12	16346	16357	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017057	TAT	2	6	16512	16517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017057	TAG	2	6	16545	16550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017057	TAC	2	6	16570	16575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017057	ATA	2	6	16623	16628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017057	AATT	2	8	16687	16694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017057	CAG	2	6	16713	16718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017057	A	7	7	16742	16748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017057	AGA	2	6	16759	16764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017057	AGA	2	6	16768	16773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017057	ATC	2	6	16783	16788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017057	CTT	3	9	16827	16835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017057	CAT	2	6	16862	16867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017057	GTT	2	6	16894	16899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017057	TA	3	6	16977	16982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017057	TGA	2	6	17026	17031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017057	AATATA	2	12	17069	17080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017057	ACA	2	6	17104	17109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017057	CAG	2	6	17141	17146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017057	AAAG	2	8	17157	17164	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017057	A	6	6	17185	17190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017057	AAG	2	6	17193	17198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017057	GTA	2	6	17201	17206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017057	TTACT	2	10	17212	17221	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017057	ATT	2	6	17243	17248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017057	ATTC	2	8	17250	17257	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017057	TAG	2	6	17299	17304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017057	AT	3	6	17310	17315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017057	ATA	2	6	17343	17348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017057	GAT	2	6	17405	17410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017057	GAA	2	6	17471	17476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017057	TA	3	6	17485	17490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017057	ATG	2	6	17529	17534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017057	GAA	2	6	17543	17548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017057	TTA	2	6	17595	17600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017057	AGG	2	6	17622	17627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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